应用微生物学：开放获取
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抽象的

基于宏基因组学的 HPV 感染患者阴道微生物群与表型之间功能关联的研究

陈奇1、钟志华、李尚福、黄建勋*、李宗义

目的：在本研究中，我们关注阴道微生物组复杂且可变的生态，以阐明表型之间的关联。

方法和结果：在一项针对 39 名台湾女性的研究中，通过使用 16S rRNA 测序数据的微生物丰度进行初步无监督聚类分析，鉴定了 4 种微生物群落类型。我们发现这些群落类型之间的物种多样性存在差异，主要体现在均匀度上（p<0.001）。与其他群落类型相比，低均匀度组的乳酸菌相对丰度较高，人乳头瘤病毒（HPV）感染较高，宫颈上皮内瘤变和鳞状上皮内病变较严重。在以加德纳菌和链球菌为主的其他类群中，我们发现了加德纳菌随着严重程度从 ASC-US 到 CIN2 和 HSIL，逐渐减少。推断的宏基因组的功能分析表明，低均匀度组显示出一些途径，包括 DNA修复、重组蛋白、DNA 复制蛋白和 DNA 活性，如嘧啶和氨基糖、核苷酸。高均匀度组的氨基酸代谢和生物合成丰富。

结论：根据我们的发现，我们强调物种均匀度可能在阴道微生物群中发挥重要作用，可能导致阴道疾病影响下的功能途径发生变化。

研究意义和影响：本研究揭示生态平衡，尤其是物种均匀度，可以塑造阴道微生物群。