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抽象的

泛癌转录组和单细胞数据揭示基质金属蛋白酶 ( MMP )基因表达谱的视角

谭金祥*、高一丹、赵力、王媛媛、王林邦

背景： MMPs是一组与癌症进展相关的家族基因，据报道，癌症中大多数MMP基因的上调与促进侵袭、血管生成和避免免疫监视有关。然而，尚未从泛癌角度研究所有MMP在转录组水平和单细胞水平的表达模式。

方法：应用癌症基因组图谱（TCGA）转录组和来自 GEO（基因表达综合）的单细胞测序泛癌数据。通过LASSO回归分析构建了基于MMP的诊断模型。通过 ssGSEA将肿瘤分为MMP评分高组和低组。通过 Serat 软件包分析单细胞数据。通过 qRT-PCR 验证 MMP 的表达特征。

结果： MMP1、MMP11和MMP12在几乎所有癌症中均上调。MMP19和MMP27在八到九种癌症类型中显着下调。相关分析证明MMP表达与肿瘤免疫和肿瘤干性之间存在潜在关系。MMP评分低组中，包括巨噬细胞、II 型 IFN 反应和 Treg 在内的免疫细胞如预期高度浸润，功能包括 Hippo 信号通路、白细胞与血管内皮细胞粘附的正向调节、T 细胞趋化性在 MMP 评分中更加活跃-高组。单细胞分析揭示了多种MMP不同细胞簇中的表达模式。其中，MMP7在巨噬细胞中高表达，MMP2在CD8 ⁺ T细胞中高表达。

结论：大多数MMP在癌症中表达增加，MMP联合显示出潜在的诊断价值。