蛋白质组学与生物信息学杂志
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丁香假单胞菌噬菌体中同义密码子使用偏差的分析：对光斑枯病噬菌体治疗的影响

沙尚克·夏尔马、安布里什·夏兰·维迪亚蒂和拉朱·波达

由丁香假单胞菌引起的晕枯病导致干豆大量损失。噬菌体疗法可以尝试作为替代治疗。为了评估同义密码子使用和密码子变异，取20个假单胞菌噬菌体进行测试。在分析这些噬菌体的毒力时可以考虑噬菌体中 GC 浓度的影响。突变偏倚和翻译选择也是预测适当偏倚的重要因素，可以通过 Nc 图和对应分析进行分析。我们的分析表明，在 20 个噬菌体中，有 3 个噬菌体（即噬菌体 D3、D3112 和 119X）具有极高的毒性，因为它们具有高翻译效率。根据我们的数据，我们得出结论，噬菌体 D3 最适合作为噬菌体疗法来治疗晕枯病。