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生物信息分析：LINC00634 在结直肠癌中的作用

刘芳、付凤仪环*、聂玉强

背景： LINC00634在食管癌中高表达，其缺失可抑制食管癌细胞的活力并诱导其凋亡。然而，目前缺乏研究LINC00634表达与结直肠癌（CRC）患者的临床病理特征、生存结果、预后因素和肿瘤免疫细胞浸润之间的关系。

目的：我们旨在研究 LINC00634 在结直肠癌中的作用。

方法：我们从TCGA（癌症基因组图谱）公共数据库、GTEx（基因型-组织表达）数据库和临床样本中获取数据。采用Wilcoxon秩和检验、Kruskal-Wallis检验和Logistic回归分析评估LINC00634表达与CRC患者临床病理特征之间的关系。构建受试者工作特征 (ROC) 曲线，以评估 LINC00634 根据曲线下面积 (AUC) 评分区分 CRC 患者和正常受试者的能力。进行单变量和多变量分析来评估预后因素和生存结果之间的关联。采用Kaplan-Meier曲线和Cox回归分析确定LINC00634表达对结直肠癌患者预后的贡献。进行免疫浸润分析和基因集富集分析（GSEA）来鉴定 LINC00634 显着相关的功能。最后，基于Cox回归数据构建列线图进行内部验证。

结果： LINC00634在CRC患者中表达上调，且与N分期、残留肿瘤、病理分期和总生存（OS）事件显着相关。ROC曲线显示LINC00634具有较强的诊断和预后能力（AUC=0.74）。LINC00634的高表达可以预测较差的疾病特异性生存（DSS；P=0.008）和较差的总体生存（OS；P<0.01）。LINC00634 的表达与 CRC 患者的 OS 独立相关（P=0.019）。GSEA和免疫浸润分析表明LINC00634表达参与基因转录、表观遗传调控和某些类型免疫浸润细胞的功能。列线图的 c 指数为 0.772 (95% CI: 0.744-0.799)。

结论：我们的研究表明 LINC00634 可以作为 CRC 患者的潜在预后生物标志物。