蛋白质组学与生物信息学杂志
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狗牙根蛋白质组的缓冲液优化

穆罕默德·塔希尔和萨米娜·努尔·沙基尔

二维(2D) 凝胶电泳是用于差异蛋白表达分析的强大技术。高分辨率二维电泳仍然是蛋白质组学中主要应用的分离技术。成功的 2D 凝胶电泳取决于适当的优化条件，最重要的是优化的缓冲液。在这项研究中，我们检查了影响 2D 凝胶结果的不同因素，包括再水化时间、还原剂、离液剂和去污剂。我们选择了狗牙根作为实验植物。提取并纯化蛋白质。为了正确溶解蛋白质样品，使用了 pH 3-10 的不同补液缓冲液，其中含有不同量的离液剂（如尿素和硫脲）、去污剂（NP-40、Triton X-100 和 CHAPS）和还原剂（β-巯基乙醇和数码地面电视）。为了进一步改善 2D 凝胶上的蛋白质谱，将溶解的蛋白质重新提取、洗涤并重新溶解在新鲜的补液缓冲液中。我们修改后的实验方案显示，狗牙根蛋白质组的蛋白质溶解度显着增加，并且蛋白质 2D 凝胶图谱得到改善。总之，我们成功地优化了二维凝胶电泳蛋白质组分析的条件。这些优化的条件将为进一步深入研究该领域奠定基础。蛋白质组学。