蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

人疱疹病毒衣壳蛋白非同义与同义取代的比较分析

维潘·库马尔·索帕尔、阿普尔巴·戴伊和阿玛帕尔·辛格

计算序列之间非同义 (dN) 到同义 (dS) 变化之间的差异来分析进化方向。在本文中，我们使用最大似然分析逐个密码子比较密切相关的HHV菌株，以及两个序列的分歧时间。我们证明，在比较密切相关的物种时，替代模型提供了进化假设。转换/转换比和 Fischer 精确检验对 dN-dS（p 距离）的影响，以及与这些 HHV 概念相关的问题也进行了讨论。我们应用了衣壳蛋白测序方法HHV-1 和 HHV-2 对衣壳结构的详细分析为进化提供了最好的证据。我们得出结论，替代模型、dN-dS、分歧时间和转变/颠换对于研究进化具有关键作用。