蛋白质组学与生物信息学杂志
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猪流感病毒H1N1亚型不同毒株神经氨酸酶和血凝素的序列比较分析

迪帕克·库马尔·夏尔马、阿尼尔·库马尔·拉瓦特、希普拉·斯里瓦斯塔瓦、拉吉夫·斯里瓦斯塔瓦和阿贾伊·库马尔

猪流感是猪和人的传染病，造成大量死亡。本研究的目的是分析来自内布拉斯加州猪的猪流感病毒A/Swine/Nebraska/(H1N1)亚型的突变可能性。使用 BLASTP 和 ClustalW 程序分析 H1N1 神经氨酸酶（GenBank 登录号：ABR28650）和血凝素（GenBank 登录号：ABR28647）的氨基酸序列的突变。我们的计算机分析预测猪流感病毒的血凝素和神经氨酸酶分别对位置225、283和240、451处的突变敏感。这些突变对其致病性具有重要意义，因为它们涉及极性或疏水性的变化。结构域和基序搜索显示，在 NA (T240A、G451S) 和 HA (I283V) 的 N-肉豆蔻酰化预测位点处检测到突变。二级结构分析预测HA和NA分别在225、283位和240、451位没有观察到结构构象变化。PROTMUTATION 程序是使用 Perl CGI 编程开发的，使用 Needleman-Wunsch 算法进行全局序列比对。该程序用于监测突变并预测突变趋势。