物理化学与生物物理学杂志
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使用分子动力学模拟研究对顺铂、奥沙利铂和 BNP3029（基于取代氰基配体的铂类似物）进行铂化后 12 聚体 DNA 寡核苷酸的形态变化进行全面比较分析

Pavankumar PNV、Ayala PY、Parker AR、Zhao M、Jair K、Chen X、Kochat H 和 Hausheer FH

顺铂是临床广泛应用的重要抗癌药物；然而，它有几个显着的局限性。为了开发新型铂类似物，需要考虑可能产生更有效的铂类似物的关键特性。在本研究中，我们使用 12 聚体 DNA（5'-CCTCTggTCTCC-3'，gg= 铂化位点）寡核苷酸进行全面的分子动力学模拟研究，该寡核苷酸已用顺铂 (1)、奥沙利铂_1R_2R (2) 和 BNP3029 进行铂化（3，一种新型取代氰基铂类似物，PtCl2[N=C(CH2)3(C6H5)]2），并使用 Kolmogorov-Smirnov 统计分析分析了大数据输出。总之，数据表明，与顺铂-DNA和奥沙利铂-DNA相比，BNP3029-DNA具有较少的A样DNA形态，因此保持了更多的B样DNA形式。