细胞与发育生物学
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利用黑米植物转录组数据计算鉴定花青素相关基因

Jae-Hyeon Oh、So-Youn Won、Jae-Hee Lee、Dong-Ho Shin 和Chang-Kug Kim

花青素是一组次级代谢产物，负责植物的颜色，其抗氧化活性已被认为是一种促进健康的物质。为了鉴定黑米籽粒中负责花青素富集的基因，我们使用 135K Oryza sativa 微阵列评估了黑米和白米品种中转录本的表达，发现 3,728 个基因与花青素色素的产生相关。其中，使用 COG 分析鉴定了 573 个保守的直系同源基因，并与现有的类黄酮途径网络进行了比较。富集途径分析最终产生了 53 种花青素生物合成候选物质。这些基因被锚定到水稻基因组的染色体上，以确定它们的遗传图谱位置，并使用最大似然法与来自拟南芥的 31 个同源蛋白质序列一起进行系统发育构建。我们的候选基因似乎要么在花青素生物合成中发挥调节作用，要么与花青素代谢相关。