蛋白质组学与生物信息学杂志
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蔗糖合酶蛋白亚家族、应激源表达序列标签数据集中结构和表达变化之间的相关性

Jayashree B、R.Pradeep、Anil Kumar 和 B.Gopal

蔗糖合酶是一种关键的调节蛋白，也是一种潜在的生物标志物用于植物的非生物胁迫反应。这些代谢酶的不同功能作用已被广泛研究。这种不依赖于 Pi 和腺苷酸的糖酵解酶在不同环境背景下的上调也已得到广泛表征。在这里，我们对蔗糖合酶的进化特征进行了分析，试图将序列变化与该蛋白质的结构和功能相关联，以及转录本分布研究所证明的其对植物应激反应机制的潜在影响。考虑到这种蛋白质在糖感应、糖输入库组织和植物发育中的作用，对该酶的进化特征的分析是有用的。基于蔗糖合酶的二级结构特征和这些蛋白质折叠背景下的序列变异图谱，我们注意到具有潜在功能意义的进化保守氨基酸。此外，我们还观察到其中一些蛋白质中存在目标肽，表明潜在的细胞定位。本手稿中提出的结果可能有助于对该蛋白质作为环境压力的潜在生物标志物和候选基因的持续研究。