抗病毒与抗逆转录病毒杂志
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对来自中非初治患者的乙型肝炎病毒基因型 E 菌株的计算机分析揭示了完整基因组的重要突变

吉斯卡·威尔弗里德·科亚韦达、罗莎琳·马查里亚、朱丽叶·罗斯·翁格斯、尤尼斯·马丘卡、罗杰·佩尔、纳西斯·帕特里斯·科马斯*

背景：尽管目前采取了预防和治疗措施，乙型肝炎病毒（HBV）仍然是一个严重的健康问题。关于中非共和国 (CAR) 流行菌株的分子特征数据很少。在这里，我们对从 CAR 患者中分离出的 HBV 全长基因组进行了测序。

方法：血清样本在班吉巴斯德研究所采集。使用桑格技术和四个重叠引物分离和测序全长病毒基因组。使用生物信息学工具对序列进行计算机分析，以确定突变和耐药性。

结果： 4个全长HBV基因组测序成功。所有四个分离株均属于基因型 E，并且在逆转录酶 (RT) 功能域 A 中包含 rtI90L 突变。一个分离株在 S-ORF 的 3' 端包含一个无义突变，导致过早终止密码子并产生短序列。所有三种表面蛋白（大、中、小表面抗原）的蛋白质序列。计算机分析表明，该同一突变体分离株还在 RT 功能域 D 中携带 rtH234N 突变，这增加了结合能并导致阿德福韦和替诺福韦的亲和力降低。

结论：乙型肝炎 E 基因型是 CAR 中流行的主要基因型。我们在 CAR HBV 毒株的 RT 基因中发现了一个突变，该突变可能与耐药性有关。因此，需要对 CAR 中循环的 HBV 菌株中的 HBV RT 进行进一步、深入的研究。