蛋白质组学与生物信息学杂志
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鹌鹑视黄醇结合蛋白 7 (RBP7) 的计算机结构预测、分析和能量计算

艾西瓦娅·蒂瓦里、维杰·拉克西米·萨克塞纳和米通·库马尔·帕特尔

具有生物动态的天然类视黄醇（视黄醇及其代谢物、维生素 A）由Coturnix japonica中的细胞外、细胞内和核蛋白介导或日本鹌鹑。类视黄醇主要通过两种介质传播，例如血浆视黄酸结合蛋白（RBP）和附睾视黄酸结合蛋白（ERABP）在体液中携带类视黄醇，而细胞视黄醇结合蛋白（CRBP）和细胞视黄酸结合蛋白（CRABP）在细胞内携带类视黄醇。在进行结构预测和能量计算时，对 RBP7 氨基酸的准确描述非常重要。本研究的目的是利用生物信息学工具和软件方法预测 Coturnix japonica 中 RBP7 的结构。RBP7 蛋白中氨基酸的 φ、ψ 值的 Ramachandran 图。使用这种计算方法，Coturnix japonica 中 RBP7 的总能量为 1047.341 KJ/mol。黄连的总最小能量为1026.898 KJ/mol或日本鹌鹑。还观察到在每个分子、官能团和原子水平上重复的能量趋势。视黄醇和视黄酸在黄芪基因表达的变化和胚胎的整体生长中起着重要的作用。这使得 RBP7 在日本鹌鹑的脂肪组织表达方面更加重要，因为 RBP7 作为一种新型脂肪特异性基因。