药物设计：开放获取
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抽象的

针对 COVID-19 抑制剂的设计和开发的计算机模拟研究

Akshata R. Pahelkar、Pritam V. Bagwe、Khushboo Maurya、Nikhil R. Pahelkar、Shreerang V. Joshi、Vikas N. Telvekar

目标：世界卫生组织宣布，中国湖北省武汉市报告了首例 COVID-19 大流行病例。感染现已广泛传播，截至 2020 年 3 月 30 日^，全球已报告 6 例感染病例，93,224 例，死亡 33,106 例。这是与公共卫生相关的国际关注问题。世界各地正在针对危机进行多项研究。有关疫苗开发、药物再利用以及新化学实体开发的各种治疗和预防假设正在接受调查。COVID-19 是属于 β 属冠状病毒家族的一种病毒。它与之前报道的SARS-CoV有相似之处。我们计划提出一种用于设计针对 COVID-19 的肽衍生特异性抑制剂的支架。

方法：我们的策略涉及设计一种肽抑制剂，该抑制剂将与 SARS-CoV-2 的 RBM 相互作用并抑制其进入细胞内。计算机辅助药物设计是可以帮助在更短的时间内实现生产力的可用工具之一。我们利用了名为 Rosetta 的在线肽设计平台、计算机辅助药物设计软件 Autodock Vena（已授权给 Nikhil Pahelkar 先生）和 Schrodinger 的药物发现套件（已授权给孟买 ICT）。

结果：我们提出了一种基于人类 ACE2 序列的肽，它与 SARS-CoV-2 的 RBM 强烈相互作用。有兴趣的读者可以利用该序列对肽序列进行进一步修饰，将其转化为拟肽。