理论与计算科学杂志
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抽象的

我们离自然有多远？药物库描述符与三肽分子相关相似度分析

Eitner K、Gawäda T、Koch U

对药物银行分子数据库中的 2D 拓扑描述符与 8,000 个三肽（核酸编码的所有可能的氨基酸组合）之间的相似性进行了统计分析。三肽分子的理论计算性质（MW、AlogP、拓扑 PSA、氢键供体和氢键受体）与药物库的拓扑描述符之间的相关性显示了简单三肽与实验室开发的具有专用生物活性的化合物之间的主要相似性。该论文提出了由描述符编码的具有相似分子特性的化合物数量分布的直方图。我们的研究开发了一种简单、创新的方法，用于大规模分析统计数据及其相关性。一些假设表明，高度加工食品是天然的抗菌和抗病毒屏障。我们的研究与文献数据进行比较证明，许多异生素在拓扑上与天然代谢物三肽相似，并且有些具有相似的治疗应用。