免疫组学研究
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免疫信息学方法-单纯疱疹病毒3糖蛋白E的多肽疫苗设计

Sahar Obi Abd Albagi、Safaa Hag Ahmed、Thana Eljozoli Mohamme、Esameldeen Ahmed Adam 和 Mohammed A Hassan

背景：单纯疱疹病毒（HSV）是一种常见的人类病原体，引起口面部粘膜表面（HSV-1）和生殖器粘膜表面（HSV-2）感染。生产性感染导致粘膜上皮形成水泡病变，随后病毒传播到感觉神经元并建立可能在宿主一生中持续存在的潜伏感染。
材料与方法：糖蛋白E【人类疱疹病毒3】的所有序列均从NCBI获得，并经过IEDB预测工具，包括B细胞和T细胞检查，其中B细胞进行表位预测、表面可及性、抗原性预测等多项测试；T细胞包括MHC I和MHC II预测工具。最后，我们利用群体覆盖率来选择与不同等位基因相关的肽的最高百分比。
结果：我们从B细胞测试中获得了一些作为疫苗衍生肽的候选肽，其中Emini表面可及性得分最高（“DEDKLDTNSVYEPYYHSDHAESSWVNRGESSRKAYDHNSPYIWPRNDYDGF”）为21.807，“LKFVDTPESL”在Kolaskar和Tongaonkar抗原性测试中得分为1.061，另一方面我们得到了与 MHC I (“KAYDHNSPY”) 和 MHC II (“MWNYHSHVF”) 中不同等位基因的主要覆盖范围相互作用的肽的最高亲和力。结论
：通过计算检验方法预测的候选表位的效率和安全程度需要通过动物模型的研究来估计，以检查它们是否能够诱导良好的防御性免疫反应，是否具有前面提到的特性，我们认为这项研究是与之前的研究相比，这是第一个有前途的基于肽的[人类疱疹病毒3]糖蛋白E疫苗。