蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

使用 Ab Designer 进行系统生物学抗体的集成设计

Trairak Pisitkun、Patrick Dummer、Poorichaya Somparn、Nattiya Hirankarn、Jeffrey B Kopp 和 Mark A Knepper

在当前大规模生物学时代，系统生物学已发展成为识别生物系统内复杂相互作用的强大方法。除了高通量鉴定和定量技术之外，基于高质量单特异性抗体的方法仍然是该方法的基本要素。为了协助大规模设计和生产用于系统生物学研究的肽导向抗体，我们开发了完全集成的在线应用程序 Ab Designer (http://helixweb.nih.gov/AbDesigner/)，以帮助研究人员选择最佳肽用于针对靶蛋白相对无序区域产生抗体的免疫原。在这里，我们描述了 Ab Designer 的功能，并将其与其他软件工具进行比较，并使用它设计了三种针对人类肾脏疾病相关蛋白的抗体，即。去氧肾上腺素、podocin 和载脂蛋白 L1。