免疫组学研究
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肽长度显着影响 MHC II 类分子的体外亲和力

卡萨尔·奥布莱恩、达伦·R·弗劳尔

背景：II 类主要组织相容性复合物 (MHC) 分子具有开放式结合凹槽，可容纳不同长度的肽。多项研究表明，位于核心结合槽外部的肽侧翼残基 (PFR) 可以影响肽结合和 T 细胞识别。通过使用 AntiJen 数据库中的数据，我们能够系统地表征 PFR 对 MHC II 类分子的肽亲和力的影响。结果：通过分析涵盖 19 个不同 HLA 等位基因的 1279 个肽延伸事件，观察到，一般来说，肽延伸导致 MHC II 类分子亲和力增加。还可以确定 MHC II 类亲和力的最佳肽长度约为 18-20 个氨基酸；肽的延伸超过该长度会导致亲和力无效或产生负面影响。结论：观察到的肽长度和 MHC II 类亲和力之间的关系对于疫苗的设计和免疫疾病表位基础的研究具有重要意义。