免疫组学研究
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默克尔细胞多瘤病毒多表位肽疫苗的预测和保存性分析：免疫信息学方法

Mawadda Abd-Elrahem Awad-Elkareem、Soada Ahmed Osman、Hanaa Abdalla Mohamed、Hadeel Abd-Elrahman Hassan、Ahmed Hamdi Abu-haraz、Khoubieb Ali Abd-elrahman 和 Mohamed Ahmed Salih

默克尔细胞多瘤病毒是一种无包膜链DNA病毒，属于多瘤病毒科，与一种罕见的乳腺癌恶性肿瘤双相关。不良的恶性肿瘤和对疾病发病的有限了解需要创新的方法。在当前的研究中，我们的目标是从所有默克尔细胞多瘤病毒株的VP1蛋白中预测结核细胞的免疫原性表位，这将有助于使用基于表位的免疫信息学方法进行我们从 NCBI 数据库中检索了默克尔细胞多瘤病毒种的 423 个全长 VP1 蛋白质序列。对这些序列进行分析保护区域，并使用 IEDB 免疫信息学算法预测表位。对于 B 细胞，三个表位被预测为肽疫苗（QEKTVY、KTVYPK 和 QEKTVYP）。对于 T 细胞，预测的 I 类肽（SLFSNLMPK 、LQMWEAISV 和 LLVKGGVEV）得知真相最大数量的 MHC I 等位基因。最高的II类MHC结合肽是（IELYLNPRM、ISSLINVHY和INSLFSNLM）。需要进行进一步的实验来确认这些预测表位在未来有效疫苗开发中的潜力。