药物代谢与毒理学杂志
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抽象的

通过计算机模拟方法预测 COX1 蛋白的抗原 MHC 肽结合物和 TAP 结合物

米什拉 S 和戈马斯 VS

在目前的分析中，GWD 的细胞色素 C 氧化酶亚基 I（CO1 或 MT-CO1）蛋白序列已用于研究 MHC 结合抗原肽、通过不同 B 细胞预测方法预测抗原肽、蛋白质溶剂可及性、极性和非极性残基分析可能暴露在蛋白质表面的区域。从蛋白质中，可以使用肽片段进行分析，并可以选择特定的九聚体来进行合理的疫苗设计。在本研究中，PSSM 和 SVM 算法用于寻找 MHC I 和 MHC II 结合肽。我们还预测了来自GWD的CO1蛋白的高亲和力TAP结合肽，其具有205个氨基酸，显示出197个九聚体。根据选择的结果，我们预测，以下可能性：