分子病理学与生物化学杂志

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微生物分析:工具、技术和挑战

阿努拉格·阿南德

高通量测序研究和新的软件工具正在彻底改变微生物群落分析,但实验和计算方法的多样性可能令人望而生畏。在这篇综述中,我们讨论了一些不同的群落分析方法,强调了各种实验方法、测序方法和分析方法的优点和缺点。我们还解决了各种人类微生物组项目中出现的一个关键问题:是否存在我们共享的丰富生物体或谱系的实质性核心?看来,在某些人体栖息地(例如手和肠道)中,个体之间的多样性是如此之大,以至于我们可以排除任何物种在所有个体中都处于高丰度的可能性:

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