蛋白质组学与生物信息学杂志
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蛋白质组学分析可深入了解拟南芥在 595 nm 光的窄波长 LED 下的反应

纳菲塞·亚瓦里 (Nafiseh Yavari)*、马克·G·莱夫斯鲁德 (Mark G. Lefsrud)

越来越多的证据表明，包括生长、光合作用和应激反应在内的多种植物过程均受到 595 nm 光的调节。然而，595 nm 诱导信号的分子机制尚不清楚。这项工作的目的是研究拟南芥叶子的比较蛋白质组变化Col-0 植物用窄波长 595 nm 光或荧光灯处理 5 天。使用在线 RP-SCX-RP 液相色谱和 LTQ 质谱仪对收获的植物样品进行分析，鉴定出 1538 种蛋白质。蛋白质相对丰度的线性回归模型揭示了总共 23 种差异丰度蛋白质 (DAP)。这些 DAP 的功能分析证明了拟南芥中几种生物机制的作用对 595 nm 光的反应，包括应激反应和代谢过程。对这些 DAP 的网络分析揭示了能量和氧化还原调节机制的重要性。进一步的分析确定了与糖酵解、ATP 合酶复合物、细胞壁修饰和类囊体膜相关的蛋白质的潜在重要作用，这些蛋白质可能调节植物对 595 nm 光的适应性反应。还发现了DAP 对 PSII 耐受能力以及相关 Ca ²⁺和 ROS 信号通路的显着富集。总的来说，这项研究为维持植物对 595 nm 光的反应的潜在分子途径提供了重要的见解。