蛋白质组学与生物信息学杂志
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人类蛋白质组中肽键类型的量化表明 DNA 密码子在生命起源之前的条件下如何组装

约瑟夫·纳哈卡

[GADV]-蛋白质世界假说 [1] 引导我对人类蛋白质组中 G、A、V、D 组装的十肽进行定量。G、A、V 和 D 氨基酸与核苷酸鸟嘌呤 (g)、胱氨酸 (c)、尿嘧啶 (u) 和腺嘌呤 (a) 相关。搜索结果显示与遗传密码一致。益生元肽键的类型可能代表了在密码子中建立碱基顺序的第一个选择能力。遗传密码经历了三个形成阶段，这解释了为什么现代密码子具有其特定的核苷酸顺序：单碱基、二碱基和现代阶段（三碱基）。氨酰-tRNA 合成酶的序列比对和 3D 结构证实了所描绘的“相关性”图片，并且该图片指示了氨酰-tRNA 合成酶如何使用“相关性”导航进入 C 端反密码子结合结构域及其内部。这里提出的发现说明了氨基酸序列可能翻译成核苷酸序列的新概念，核苷酸序列可以以与所需的蛋白质-RNA相互作用相关的相互作用或相反的模式进行。希望它可以用于合成生物学。