蛋白质组学与生物信息学杂志
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SARS-Cov-2 病毒孔蛋白：从核苷酸到氨基酸的多组学见解

Manish Sarkar1*、Paul Etheimer2、Victor Hannothiaux1*、Soham Saha1*

COVID-19 是由 SARS-CoV-2 引起的，截至 2022 年 5 月 1 日，该病毒已影响全球 5 亿多人，并导致超过 600 万人死亡。批准的紧急使用疫苗对于这种毁灭性的大流行能够挽救生命。病毒孔蛋白是 SARS-CoV-2 生命周期的重要参与者，也是其发病机制的主要因素。我们从顺序和结构的角度研究了 SARS-CoV-2 的两个重要病毒孔蛋白 (i) Orf3a 和 (ii) 包膜 (E) 蛋白。Orf3a 是一种阳离子选择性病毒离子通道，已被证明会破坏内体途径。E蛋白是SARS-CoV蛋白质组中最保守的蛋白质之一，影响ERGIC相关通路。水介质通过病毒孔蛋白介导阳离子的非选择性易位，影响宿主细胞区室中的离子稳态。这种离子不平衡可能会导致宿主细胞炎症反应增加。我们的结果揭示了病毒孔蛋白的作用机制，可以潜在地用于抗病毒疗法的开发。我们的结果证实了之前发表的来自感染了 COVID-19 的肺泡细胞的转录组数据，其中受离子通道直接影响的炎症反应和分子调节因子上调。