克隆与转基因

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国际标准期刊号: 2168-9849

抽象的

白菜类HMG-CoA合酶基因的序列分析

Hina Awais、Zahid Mushtaq、Sumaira Sarwar 和 Amer Jamil

萜类化合物在植物中通过甲羟戊酸 (MVA) 和甲基赤藓糖醇磷酸 (MEP) 途径合成,其中异戊烯基二磷酸 (IPP) 是主要中间代谢产物。3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶 A 合酶 ( HMGS ) 是类异戊二烯生物合成 MVA 途径中的后续酶,催化乙酰乙酰辅酶 A 与乙酰辅酶 A 缩合生成 HMG-CoA。不同种类的植物和动物中存在不同的HMGS基因,用于合成次生代谢产物。本研究旨在对白菜型油菜 (Brassica rapa)的 HMG-CoA 基因序列进行生物信息学比较和分析。与不同物种的其他序列。该基因序列具有925 bp的编码DNA序列,并已提交至美国国家生物技术信息中心(NCBI)并具有登录号。MF577077。核苷酸和蛋白质序列的比对是通过Geneious进行的。利用不同的生物信息学工具和软件对白菜中分离的HMG-CoA合酶类基因序列进行了生物信息学比较,包括结构和功能分析。这些比较提供了有关该基因的特性、遗传和功能多样性以及氨基酸取代的更好信息。

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