小儿研究进展
开放获取

抽象的

诺如病毒GII.4变种的时空进化动力学

Ruta Kulkarni、Atul M. Walimbe、Shobha D. Chitambar

背景：诺如病毒（NoV）是全球散发性儿童胃肠炎的第二大常见原因。GII.4 基因型的 NoV 在全球范围内占主导地位，并在编码主要衣壳蛋白的 VP1 基因中经历持续进化，导致新变体的出现，迄今为止已识别出 14 个 GII.4 变体。方法：本研究使用贝叶斯方法、系统发育学和迁移模式分析，对代表每个 GII.4 变体的完整 VP1 序列数据集进行了全球循环的 GII.4 NoV 的时空进化动力学研究。结果：GII.4 VP1 的估计平均进化速率为每年每个位点 5.1x10-3 个核苷酸取代（子/位点/年），最近共同祖先 (tMRCA) 的时间约为 1971 年，最可能的祖先地点是美利坚合众国（USA）。14 种已知的 GII.4 变体表现出不同的进化速率（4.5–7.4x10-3 子/位点/年）和 tMRCA（~1984 至~2006），其中大多数以美国/亚洲作为其祖先位置。迁移模式分析表明澳大利亚-新西兰、印度和南欧在 GII.4 诺如病毒的全球传播中发挥着重要作用。结论：该研究有助于理解GII.4诺如病毒进化动力学。和南欧在 GII.4 诺如病毒的全球传播中。结论：该研究有助于理解GII.4诺如病毒进化动力学。和南欧在 GII.4 诺如病毒的全球传播中。结论：该研究有助于理解GII.4诺如病毒进化动力学。