转录组学：开放获取
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寻求更具耐受性的水稻：铁浓度有多高会影响选择性剪接？

阿图尔·特谢拉·德·阿劳霍·儒尼奥尔、丹尼尔·达·罗莎·法里亚斯、雷尔森·施赖纳特·多斯桑托斯、马塞洛·诺盖拉·多·阿马拉尔、路易斯·威廉·帕切科·阿尔杰、丹尼拉·德·卡西亚·奥利维拉、索兰热·费雷拉·达·西尔维拉·西尔维拉、罗热里奥·奥利维拉·德索萨、尤金尼亚·杰西拉·博拉塞尔·布拉加、卢西亚诺·卡洛斯·达玛雅和安东尼奥·科斯塔·德·奥利维拉

水稻（Oryza sativa L.）是全球主要粮食作物，也是植物研究的重要模式生物。最近的报告表明，选择性剪接受到许多应激条件的影响，这表明它对于适应不利环境的重要性。由于有关该主题的信息很少，本研究旨在探索营养液中高铁浓度引起的剪接模式的变化。在这里，我们对相对耐受的水稻品种 BRS Querência 在铁过量、浓度为 300 mg L-1 Fe+2 的情况下转录组中不同类型的连接和剪接事件进行了定量。标准条件下（对照）的植物有 127,781 个不同的剪接点，而受胁迫的植物有 123,682 个不同的剪接点。规范（98.85% 和 98.91%），半规范（0.73% 和 0. 在对照植物和胁迫植物中分别发现了70％）和非规范（0.42％和0.40％）的连接。内含子保留是最常见的事件（44.1％和47.4％），其次是3'剪接位点（22.6％和21.9％），外显子跳跃（18.9％和17.3％）和替代5'剪接位点（14.4％和13.4％） ）分别在对照和胁迫植物中。我们还发现了 25 个与翻译后修饰相关的差异表达基因（5 个上调，20 个下调）。这些结果代表了理解植物胁迫反应如何在铁耐受基因型中发生的重要一步，揭示了参与铁胁迫反应的新基因。对照植物和胁迫植物中分别存在外显子跳跃（18.9%和17.3%）和替代5'剪接位点（14.4%和13.4%）。我们还发现了 25 个与翻译后修饰相关的差异表达基因（5 个上调，20 个下调）。这些结果代表了理解植物胁迫反应如何在铁耐受基因型中发生的重要一步，揭示了参与铁胁迫反应的新基因。对照植物和胁迫植物中分别存在外显子跳跃（18.9%和17.3%）和替代5'剪接位点（14.4%和13.4%）。我们还发现了 25 个与翻译后修饰相关的差异表达基因（5 个上调，20 个下调）。这些结果代表了理解植物胁迫反应如何在铁耐受基因型中发生的重要一步，揭示了参与铁胁迫反应的新基因。