血液病与血栓栓塞疾病杂志
开放获取

抽象的

使用贝叶斯模型定位 HBV 耐药性突变

Gadareth Higgs、林志祥、Valeria Cento Valentina Svicher、Shilpa Hattangadi、张静

简介：乙型肝炎病毒（HBV）非常常见，且一直难以治疗，主要是因为其逆转录酶聚合酶基因突变率较高。我们研究的目的是利用贝叶斯统计来确定 HBV 基因组内的突变位置。

材料和方法：序列数据来自托尔维加塔大学合作者提供的患者数据，其中包括各种药物的 73 例治疗初治和 215 例治疗失败。将 Metropolis-Hastings 算法应用于数据以确定与耐药性相关的突变位置。

结果：对于氨基酸位置80-250，在治疗失败组中显示有19个位置发生突变。19 个位置中的 15 个属于 HBV 的 D 基因型，而另外 4 个属于源于药物拉米夫定 (LMV) 的 A 基因型。对于氨基酸位置250-344，16个位置发生突变，其中16个位置中的7个源自D基因型中的LMV。四种突变源自 A 基因型的 LMV。

结论：本研究确定了以前未知的突变位置并确认了先前研究中确定的位置。罗马大学 Tor Vergata 的合作者已使用 454 焦磷酸测序仪通过实验验证了突变位置。希望对这些突变的了解能够改善治疗方案。此外，随着基因组数据可用性的增加，未来可以对更大的 HBV 数据集和其他疾病进行研究。