组织病理学（或组织学）包括在放大镜下检查测试的整个组织。病理学研究机构获得了三种基本类型的例子。更大的例子包括在外科手术中排出的整个器官或其部分。插图包括子宫切除术后的子宫、结肠切除术后的巨大内部或扁桃体切除术后的扁桃体。
组织切片而不是整个器官被抽出作为活组织检查，这通常需要较少的手术方法，可以在患者意识清醒但安静的情况下进行。活组织检查包括提取活组织检查，其中使用手术刀片抽空组织（例如，提取可疑痣的皮肤）或中心活组织检查，其中将针嵌入可疑肿块中，以排出可以进行检查的组织或中心组织。在放大仪器下进行分析（例如研究胸部隆起）。
液体和少量组织（单个细胞而不是细胞聚集，例如来自肺周围的液体内部）可以通过细针穿刺（FNA）获得。这是使用比中心活检的一部分更细的针进行的，但采用了比较策略。这种材料通常是流体而不是坚固的，并且提交用于细胞学而不是组织学（参见细胞病理学）。