基因组印记发生在植物中，其中一个亲本的基因与另一亲本的基因具有不同的表达特性。由于杂交在植物进化和植物育种中的重要性，它具有潜在的重大后果，并提供了一种可以隐藏多代遗传变异的机制。核组织研究表明，染色体和基因组位置与F1杂种中的印记相关，外围基因组往往优先表达。在一些近交、多倍体杂种中，例如小黑麦（小麦与黑麦的杂种），用去甲基化剂氮胞苷处理会释放隐藏的变异，这些变异可能由于印记现象而丢失。
