蛋白质组学与生物信息学杂志
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家蚕血淋巴提取物对金黄色葡萄球菌的体外和计算机模拟方法的严格评估

Harinatha Reddy A、Srinivasulu C 和 Venkatappa B

新出现的耐药革兰氏阳性病原体需要发现新的药物靶点并开发新的治疗方法。我们专注于抑制金黄色葡萄球菌生长的抗菌蛋白。在本研究中，使用第五龄家蚕幼虫并通过血腔内注射细菌样品来感染金黄色葡萄球菌。感染 24 小时后从健康和感染的幼虫中收集血淋巴，并在 eppendorf 管中保存在 -4°C 下直至使用。通过经典的井扩散法制备血淋巴提取物并测定抗菌活性。与健康血淋巴提取物相比，从受感染幼虫制备的血淋巴提取物对金黄色葡萄球菌表现出最大的抑制区。使用生物信息学工具找出家蚕抗菌肽（例如 Moricin 和 Cecropin）与三种不同药物靶蛋白甘油磷酸脂磷壁酸合酶（PDB：2W5Q）、ABC 转运蛋白（PDB：1P99）和来自金黄色葡萄球菌的 DNA 旋转酶 (PDB: 2XCO)。Hex Docking 软件用于对接研究。相互作用模式和结合结果可以用对接能来表示。DNA旋转酶分别与Moricin和Cecropin对接获得最佳结合能(-702.13 Kcal/mol和-639.39 Kcal/mol)。Hex Docking 软件用于对接研究。相互作用模式和结合结果可以用对接能来表示。DNA旋转酶分别与Moricin和Cecropin对接获得最佳结合能(-702.13 Kcal/mol和-639.39 Kcal/mol)。Hex Docking 软件用于对接研究。相互作用模式和结合结果可以用对接能来表示。DNA旋转酶分别与Moricin和Cecropin对接获得最佳结合能(-702.13 Kcal/mol和-639.39 Kcal/mol)。