蛋白质组学与生物信息学杂志
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玉米 AAAP 基因家族的全基因组分析

盛雷、邓林、颜汉伟、赵阳、董庆、李倩、李晓宇、程北九、江海洋

AAAP（氨基酸/生长素通透酶）基因编码一个大家族的转运蛋白。AAAP 家族的一些成员已在拟南芥和水稻 (Oryza sativa) 中得到表征。然而，人们对玉米 (Zea mays) 中的 AAAP 基因知之甚少。因此，我们进行了系统的生物信息学分析来表征玉米中的所有 AAAP 基因，其中包括基因组序列、保守蛋白结构域、染色体位置、系统发育关系、基因重复和基因表达谱的分析。在本研究中，鉴定出 71 个 ZmAAAP 基因，并将其命名为 ZmAAAP01 至 ZmAAAP71。玉米中 AAAP 基因的数量比拟南芥 (43) 和水稻 (58) 的数量还要多。我们发现玉米基因组中 AAAP 基因重复的比例较高，这有助于 AAAP 基因家族的扩展。此外，片段重复在玉米 AAAP 基因扩增中发挥了重要作用。AAAP基因在玉米10条染色体上分布不均匀，其中31个基因分布在节段染色体上的12个簇内。EST分析和转录组数据均表明大多数ZmAAAP基因表现出丰富的表达模式，表明玉米AAAP基因家族具有多样化且新颖的功能。这里提出的结果为玉米 AAAP 基因家族的进一步功能分析提供了有用的信息。EST分析和转录组数据均表明大多数ZmAAAP基因表现出丰富的表达模式，表明玉米AAAP基因家族具有多样化且新颖的功能。这里提出的结果为玉米 AAAP 基因家族的进一步功能分析提供了有用的信息。EST分析和转录组数据均表明大多数ZmAAAP基因表现出丰富的表达模式，表明玉米AAAP基因家族具有多样化且新颖的功能。这里提出的结果为玉米 AAAP 基因家族的进一步功能分析提供了有用的信息。