糖类组学与脂质组学杂志
开放获取

抽象的

高基因组突变率是多重耐药结核分枝杆菌谱系 4 哈勒姆基因型成功传播的基础

奈拉·德克希尔

U了解耐多药结核病 (MDR-TB) 是如何出现和传播的，特别是在 HIV 阴性的情况下，可能有助于破译芽孢杆菌固有的致病因素。在这里，我们彻底探索了突尼斯北部结核分枝杆菌谱系 4 (L4)-哈勒姆基因型的种群结构，该基因型从一开始就在 HIV 阴性年轻人中引起了大规模耐多药结核病的爆发。为此，我们通过分析所有显示哈勒姆 spoligo 型特征的结核分枝杆菌分离株（N = 253），确保了哈勒姆基因型在流行地区 11 年的全面覆盖。我们对 94 个代表性分离株进行了 24 位点 MIRU-VNTR（多重散布重复单元变量串联重复）分型和全基因组测序。然后进行了各种群体遗传学和进化分析。我们披露了哈勒姆基因型发生流行病传播的倾向，无论药物敏感性模式如何（近期总体传播率为 83%）。整个耐多药结核病的流行与单一药物敏感祖细胞克隆有关，该克隆的存在可以追溯到 124 年前。引人注目的是，估计总体高突变率接近全球传播的 L2-北京亚系，这一发现与几乎同时获得的多重耐药性和补偿性突变一致。如此高的突变率也解释了来自已建立流行病学直接联系的患者的分离株基因组之间核苷酸差异数量增加的原因。综上所述，我们的数据揭示了突尼斯北部进化的哈勒姆基因型的突变率相对较高，这是一个固有的标志，很可能通过快速获得补偿性突变导致成功传播的多药耐药克隆的出现。如果不加以遏制，这种快速发展的哈勒姆克隆目前在地理上仍然受到限制，可能会对欧洲地中海地区构成威胁。