蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

消耗固定增益的新型质谱表位作图方法

RF El-Kased、C. 科伊、P. 洛伦兹、H. 蒙哥马利、K. 田中、H.-J。蒂森和莫·格洛克

描述了在溶液中并去除固定抗体的基于色谱的表位作图程序的开发和应用。用抗原消化试剂。然后尺寸在将肽混合物暴露于单克隆抗体之前和之后进行排阻微色谱柱(SEC) )。含有表位的肽与抗体亲和力结合，从而形成稳定的复合物，与所有高质量器件一样早期洗脱，而所有未结合的低质量肽则较晚期洗脱比较。存在和不存在抗体时的时装曲线显示仅针对标记表位的肽发生变化，从而能够直接识别表位。为了开发该方法，将结合含有重组抗原 Fibrillarin 和 RA33 的 His 标签与抗 His 标签单克隆抗体使用。该方法测定单克隆抗体所针对的RA33上的表位，使用MS/MS核酸序列鉴定了表位序列(85短IDGRVVEPKRA95)。这种方法的优点包括样品消耗少、处理步骤少、分析持续时间。我们的方法，我们的最终目标是开发一种筛选方案，更新患者中的主要表位，这些表位可能适合将来进行个性化治疗所需的患者分层。应用该方法测定单克隆抗体所针对的RA33上的表位，使用MS/MS核酸应答鉴定了表位序列(85IDGRVVEPKRA95)。这种方法的优点包括样本消耗少、处理步骤少、分析持续时间短。通过我们的方法，我们的最终目标是开发一种筛选程序，收集患者中的主要表位，这些表位可能适合将来进行个性化治疗所需的患者分层。应用该方法测定单克隆抗体所针对的RA33上的表位，使用MS/MS 肽解密了表位序列(85IDGRVVEPKRA95)。这种方法的优点包括样本消耗少、处理步骤少、分析持续时间短。通过我们的方法，我们的最终目标是开发一种筛选程序，建立患者中的主要表位，这些表位可能适合将来进行个性化治疗所需的患者分层。