免疫组学研究
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抽象的

细胞和分子相互作用本体论的新范式：从 CMM 模型到 IMGT-ONTOLOGY

玛丽-保尔·勒弗兰克、皮尔-路易吉·洛里尼、圣托·莫塔

背景：生物学正在快速走向其他学科的良性循环：从数据到定量建模，再回到数据。模型通常由数学家、物理学家和计算机科学家开发，用于将定性或半定量的生物学知识转化为定量方法。为了消除生物学和其他学科之间的语义混淆，有必要列出一个连贯定义的最重要和最常用的概念。结果：我们提出了一种为本体生成新概念的新颖范式，从模型开始而不是开发数据库。我们应用这种方法从基于代理的模型开始生成细胞和分子相互作用的概念。这项工作提供了一个坚实的基础设施，有助于克服生物学家和数学家、物理学家和计算机科学家在多学科领域互动时出现的语义歧义。结论：这项工作代表了 IMGTONTOLOGY 中将分子本体论与细胞本体论联系起来的首次尝试，IMGTONTOLOGY 是免疫遗传学和免疫信息学领域成熟的本体论，也是生命科学生物学的范例。随着模型在生物学和医学中的使用越来越多，连接从分子到细胞再到组织和器官的不同层次的需求变得越来越重要。IMGTONTOLOGY 是免疫遗传学和免疫信息学领域成熟的本体论，也是生命科学生物学的范例。随着模型在生物学和医学中的使用越来越多，连接从分子到细胞再到组织和器官的不同层次的需求变得越来越重要。IMGTONTOLOGY 是免疫遗传学和免疫信息学领域成熟的本体论，也是生命科学生物学的范例。随着模型在生物学和医学中的使用越来越多，连接从分子到细胞再到组织和器官的不同层次的需求变得越来越重要。