蛋白质组学与生物信息学杂志

蛋白质组学与生物信息学杂志
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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

基于 Python 的亲水性图来评估蛋白质的暴露和埋藏区域

P. Pandarinath、A. Appa Rao 和 G. Lavanya Devi

预测蛋白质的抗原区域对于评估多肽链暴露或隐藏区域的状态至关重要。这可以通过使用 Hoop-Woods 标度值计算和绘制蛋白质的亲水性来实现。因此,在本文中,我们利用 Python 语言作为架构,利用各种功能属性,在 x 轴上绘制了蛋白质 Hoop-Woods 尺度氨基酸序列的亲水性图,在 y 轴上绘制了疏水性或亲水性程度作为 scipy、matplot 和 numpy 模块。已报道使用唾液酸酶 4 酶的案例研究。程序代码可根据要求提供。

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