理论与计算科学杂志

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国际标准期刊号: 2376-130X

抽象的

基于蛋白质序列预测B因子的研究

景润玉、王跃龙、吴一鸣、华永攀、代旭1、李梦龙

B 因子,也称为 Debye-Waller 因子或温度因子,是蛋白质灵活性的描述符,常用于 PDB(蛋白质数据库)格式文件中。B 因子可以通过 X 射线散射从蛋白质晶体中测量,但不能直接从蛋白质序列中获得。因此,仅根据蛋白质序列预测B因子可以为相关研究人员提供一些参考。在本研究中,我们尝试根据蛋白质序列预测 B 因子。AAindex中的信息和预测的蛋白质二级结构、相对可及性、无序性和能量变化用于描述氨基酸残基。使用四种机器学习方法进行建模和预测。5折交叉验证用于评估建模性能。因此,

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