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抽象的

用于识别未比对 DNA 序列中转录因子结合位点的结构化进化算法

Shripal Vijayvargiya、Pratyoosh Shukla

从基因上游区域鉴定转录因子结合位点（TFBS）也称为基序，仍然是一个非常重要且尚未解决的问题，特别是在高等真核生物基因组中。在本文中，我们提出了一种识别转录因子结合位点的进化方法。该方法基于结构化遗传算法。在这种方法中，个体被表示为结构化树，帮助我们找到可变长度的主题。简单的 GA 只能找到固定长度的主题，而所提出的方法可以找到可变长度的主题。我们将这种方法应用于各种数据集，结果表明它可以找到对于结合位点既有效又高效的正确结果。