生物化学与药理学：开放获取
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抽象的

朊病毒蛋白结构中π-π堆积和π-阳离子的调查

张家普

π-π 堆积和 π-阳离子显然对维持正常细胞朊病毒蛋白 (PrP) 的结构稳定性做出了一些贡献。这篇短文是对PDB（www.rcsb.org）库中列出的所有PrP结构中的π-π堆积和π-阳离子进行调查。我们发现以下重要的 π-π 堆叠：Y218–F175– Y169（围绕 β2-α2 环）、Y162–Y128（连接两条 β 链）、F141–Y150–Y157（在 α 螺旋 1 中）、H187 –F198（连接α-螺旋2和α2-α3环）；我们还发现了以下重要的π-阳离子：F141–R208.(N)NH2（连接β1-α1环和α-螺旋3），Y128–R164.(N)NH2–Y169（连接β-链1和β2-α2 环）。因此，对于 PrPs，存在一条覆盖 β2-α2 环的长“π 链”Y218– F175–Y169–R164–Y128–Y162，并且存在另一条长“π 链”R208–Y141–Y150– Y157– F198– H187 覆盖 α 螺旋 1。