生物学与医学高级技术
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抽象的

基因组时代检测和追踪食源性微生物的微阵列应用的进展

李宝光、Isha R Patel、Ben D Tall 和 Christopher A Elkins

食源性微生物引起的疫情在全世界范围内造成严重的公共卫生和食品安全问题。人们非常需要快速、灵敏和高通量的方法来检测和追踪食品、水和其他环境中的这些病原体。DNA 基因组技术的最新进展通过捕获菌株的总基因组内容和伴随的比较系统发育，实现了菌株的高通量分析。微阵列特别适合在一次实验中提取大量基因组 DNA 序列信息，例如数百种食源性分离株的基因或遗传特征。因此，在过去的二十年里，由于可以获得数千个完整的和草案的微生物基因组，微阵列技术取得了巨大的进步，这一进步导致了更新的微阵列的设计和制造，这些微阵列现在可以识别低至单核苷酸多态性的基因序列变异。DNA 微阵列仍然是快速、精细地对食源性微生物进行基因组分析的有用工具。在这篇综述中，我们将主要讨论病原体检测、血清型鉴定以及利用我们使用该技术的第一手经验追踪各个食源性菌株的遗传多样性和污染源。