蛋白质组学与生物信息学杂志
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二维凝胶电泳分析人血浆蛋白质组的有效方法

亚斯明·艾哈迈德和纳伦德拉·夏尔马

血浆蛋白质组分析越来越多地产生生物标志物人类疾病的发现。然而，血浆中高丰度的蛋白质、过量的盐和脂质使得分析非常具有挑战性。因此有必要改进血浆蛋白二维凝胶电泳分析前后的样品制备程序。本研究的目的是通过检查以下参数来开发一种可重复的方法：(1) 高丰度蛋白质的去除 (2) 不同沉淀方法的效果 (3) 将使用改良田口方法的优化补液缓冲液与标准补液进行比较(4)比较不同染色方法的效果。我们的结果表明，两种高丰度蛋白质的消耗改善了人血浆中丰度较低蛋白质的可视化，并且用 TCA/丙酮沉淀可以实现有效的样品浓缩和脱盐。我们发现，与标准补液缓冲液相比，使用优化的补液缓冲液可提高蛋白质溶解度，提高 2D 凝胶的分辨率和重现性。我们还发现，与考马斯染色相比，通过银染色和荧光染色对 2D 凝胶轮廓进行可视化增强了低丰度血浆蛋白的检测。总之，我们研究中的优化条件可用于生产更好的参考血浆样品 2-DE 凝胶，用于鉴定新的 我们发现，与标准补液缓冲液相比，使用优化的补液缓冲液可提高蛋白质溶解度，提高 2D 凝胶的分辨率和重现性。我们还发现，与考马斯染色相比，通过银染色和荧光染色对 2D 凝胶轮廓进行可视化增强了低丰度血浆蛋白的检测。总之，我们研究中的优化条件可用于生产更好的参考血浆样品 2-DE 凝胶，用于鉴定新的 我们发现，与标准补液缓冲液相比，使用优化的补液缓冲液可提高蛋白质溶解度，提高 2D 凝胶的分辨率和重现性。我们还发现，与考马斯染色相比，通过银染色和荧光染色对 2D 凝胶轮廓进行可视化增强了低丰度血浆蛋白的检测。总之，我们研究中的优化条件可用于生产更好的参考血浆样品 2-DE 凝胶，用于鉴定新的疾病标记物。