植物生物化学与生理学杂志
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通过酶错配切割验证病型分型的高效通量协议

穆罕默德·贾哈尔、布拉德利·蒂尔、阿米尔·阿尔伯特尼、阿拉·斯基海塔、穆罕默德·伊马德·埃丁·阿拉比和尼扎尔·米尔阿里

真菌致病型的早期诊断是植物育种者最重要的方面之一。它提供了一种快速方法来选择正确的突变株系，以确保抗病性的持久性以及适当的田间管理实践。传统的病原体诊断工具基于目标培养、PCR 方法和/或特定植物基因型疾病反应的表型评估。这些方法仅检测已知的病原体，可能会引入偏差，并且由于其范围狭窄而可能无法识别新的变异或种族。虽然许多植物和动物物种都描述了酶促错配切割，但还需要验证单倍体微生物的技术。在这项工作中，优化了尖镰孢致病分型的低成本方法。sp。立方体（Foc），利用自提取核酸酶和琼脂糖凝胶电泳确定了香蕉枯萎病（Musa spp.）的病原菌。基因特异性引物是根据整个真菌基因组设计的，用于对主要香蕉生产国主要品种的 Foc 代表进行酶促错配切割。使用基因特异性引物对优化两个 SNF1 和 FOW2 基因中的酶促错配切割和多态性发现。该方案快速、廉价，并且可以强有力地区分 Foc 菌株的致病型，无需 DNA 测序的高信息学负载。基因特异性引物是根据整个真菌基因组设计的，用于对主要香蕉生产国主要品种的 Foc 代表进行酶促错配切割。使用基因特异性引物对优化两个 SNF1 和 FOW2 基因中的酶促错配切割和多态性发现。该方案快速、廉价，并且可以强有力地区分 Foc 菌株的致病型，无需 DNA 测序的高信息学负载。基因特异性引物是根据整个真菌基因组设计的，用于对主要香蕉生产国主要品种的 Foc 代表进行酶促错配切割。使用基因特异性引物对优化两个 SNF1 和 FOW2 基因中的酶促错配切割和多态性发现。该方案快速、廉价，并且可以强有力地区分 Foc 菌株的致病型，无需 DNA 测序的高信息学负载。