蛋白质组学与生物信息学杂志
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选定的茎点菌物种的计算机分子进化分析：比较方法

Devanand M. Dangre、Dnyaneshwar P. Rathod、Aniket K. Gade 和 Mahendra K. Rai

茎点霉属，一种常见的植物病原体在分类学上是有争议的。茎点霉的传统分类系统是有效的，但需要大量的专业知识才能应用，这导致了茎点霉属的高度多系化。分子分类学技术的出现为许多经典分类学方法无法解决的问题提供了解决方案。基于分子数据构建系统发育树的方法被广泛用于确定进化关系。在本研究中，我们选择了28S、18S和5.8S的ITS区核苷酸序列、肌动蛋白基因序列和β微管蛋白基因序列，用于进化关系的计算机分析。该研究的主要目的是评估遗传变异和相关性以及调查、鉴定、十一个选定的茎点菌属物种之间的分类和进化关系。通过应用各种统计测试来确认我们的结果。结果表明，物种具有许多离散的、高度分化的遗传单位。相反，一些物种彼此之间具有高度的序列相似性和同一性，这在经典中被发现是不同的。我们的系统发育分析表明，在两个由此产生的点霉物种群体中的一个中，第一次物种形成事件很快就会发生第二次物种形成事件。