蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

深入了解恶性疟原虫法尼基转移酶 (PfFT) 3d7 的结构和功能特征：比较建模和对接研究

Pradeep Kumar M、Kranthi Raj.K、D. Ramachandran、Pavan Kumar MNS、Radha Vaddavalli 和 P. Jhansi lakshmi

为恶性疟原虫法尼基转移酶 (PfFT) 开发了三维模型，该模型尚未通过 X 射线晶体学或 NMR 凭经验解决。使用法尼基转移酶蛋白 2ZIR 2.4 Å（大鼠）和 1JCQ 2.3 Å（人）中等分辨率 X 射线晶体学结构，使用同源建模进行结构预测。前者与目标 PfFT 蛋白的序列同一性为 36%，后者为 35%。3D 模型是使用 Discovery studio 2.5 中的建模器生成的。能量细化也在建模器协议中进行。验证研究显示 88.2% 的残基 (750) 位于有利区域。此外，还使用 ​​GOLD 研究了一些抑制剂针对模型蛋白的结合亲和力。结果表明，Arg-551、Tyr-824、Tyr-600 被发现是 PfFT 与许多抑制剂相互作用的残基之一。我们的研究结果可能有助于设计新的、更有效的 PfFT 抑制剂。。

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