蛋白质组学与生物信息学杂志
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通过计算机方法研究 CYB 基因 T15458C 和 T15663C 突变对呼吸的影响

Mulyani R、Destiarani W、Rahmawati UM、Yusuf M、Subroto T、Iman P. Maksum*

糖尿病和白内障是印度尼西亚常见的线粒体疾病，是由于线粒体中通过氧化磷酸化 (OXPHOS) 产生的 ATP 缺乏而导致的。OXPHOS 链由核 DNA 和线粒体 DNA 基因编码的五种复杂蛋白质组成。其中一种基因是CYB基因，其位点位于线粒体 DNA 中。CYB基因编码复合物 III 亚基、细胞色素 b（一种电子转移剂）的一部分。在 2 型糖尿病患者的 T15458C 和白内障患者的 T15663C 处发现了一种新的突变，这两种突变都位于 CYB中基因，导致氨基酸改变 S238P 和 I306T。本研究通过计算机模拟方法研究了线粒体 DNA CYB基因中的 T15458C 和 T15663C 突变与 OXPHOS 过程之间的关系。野生型和突变型CYB使用 Modeller 9.19 和 5XTE 模板通过同源建模进行建模，然后使用 Ramachandran 图、包装质量评分和 DOPE 配置文件进行评估。S238P突变体结构分析的结果表明，脯氨酸由于氢键的丢失而充当螺旋破坏者，而I306T由于突变体中螺旋稳定剂的丢失而导致疏水相互作用。假设苏氨酸磷酸化突变也会破坏复合物的稳定性，正如 ΔΔG < 0 所证明的那样。总之，S238P 和 I306T 突变影响复合物 III 作为呼吸过程中电子转移剂的功能。