蛋白质组学与生物信息学杂志
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人血清中膜蛋白的分析

范德丹、陈泰上、范廷明、杜安来、阮碧妮、潘文志

血清和膜蛋白是蛋白质组分析最有吸引力的两个目标。以往的膜蛋白研究往往集中于组织样本，而对血清中膜蛋白的研究仍然有限。在本研究中，人白蛋白和 IgG 耗尽血清已用于通过 SDS-PAGE 进行蛋白质组分离。染色后，将含有蛋白质组分的凝胶切割并用胰蛋白酶消化。通过纳米液相色谱-电喷雾电离质谱（NanoLCESI-MS/MS）分析从每个凝胶切片中提取的肽混合物。通过 Mascot v1.8 软件鉴定蛋白质，并通过 MSQuant v1.5 软件验证。结果，数据库包含 1,216 个膜蛋白，其中 469 个（38. 基于三种不同的跨膜预测应用程序（Phobius、TMHMM 和 SOSUI）鉴定出具有至少一个跨膜结构域 (TMD) 的 6%) 膜蛋白。根据基因本体论，这些蛋白质根据其作用被进一步表征并分为不同的功能类别，例如细胞成分、分子功能和生物过程。我们的结果表明，膜蛋白质组学将允许更多与疾病相关的途径研究，并将有助于更好地了解药物靶点。