免疫组学研究

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国际标准期刊号: 1745-7580

抽象的

AntiJen:集成功能、热力学、动力学、生物物理和细胞数据的定量免疫学数据库

Christopher P Toseland、Debra J Clayton、Helen McSparron、Shelley L Hemsley、Martin J Blythe、Kelly Paine、Irini A Doytchinova、Pingpingguan、Channa K Hattotuwagama 和 Darren R Flower

AntiJen 是一个数据库系统,专注于免疫学和疫苗学背景下的动力学、热力学、功能和细胞数据的整合。与其前身 JenPep 相比,该界面已完全重写和重新设计,现在提供更广泛的搜索方法,包括核苷酸和肽 BLAST 搜索。在数据归档方面,AntiJen 拥有更丰富、更完整的广度、深度和范围,数据库条目数量已增至超过 31,000 条。AntiJen 提供同类中最完整、最新的数据集。虽然 AntiJen v2.0 保留了对 T 细胞和 B 细胞表位的关注,但其最大的新颖之处在于对各种免疫分子相互作用的连续定量数据进行归档。这包括肽与 TAP 和主要组织相容性复合物 (MHC) 结合的热力学和动力学测量、肽-MHC 复合物与 T 细胞受体的结合、抗体与蛋白质抗原的结合以及一般免疫学蛋白质-蛋白质相互作用。该数据库还包含来自 MHC 和其他免疫分子的位置特异性肽库和生物物理数据的定量特异性数据,以扩散系数和细胞表面拷贝数的形式。AntiJen 的用途包括疫苗和诊断学的设计,例如四聚体和其他实验室试剂,以及帮助参数化免疫系统的生物信息学或数学模拟模型。该数据库可通过 URL 访问:http://www.jenner.ac.uk/antijen。肽-MHC 复合物与 T 细胞受体结合、抗体与蛋白质抗原结合以及一般免疫学蛋白质-蛋白质相互作用。该数据库还包含来自 MHC 和其他免疫分子的位置特异性肽库和生物物理数据的定量特异性数据,以扩散系数和细胞表面拷贝数的形式。AntiJen 的用途包括疫苗和诊断学的设计,例如四聚体和其他实验室试剂,以及帮助参数化免疫系统的生物信息学或数学模拟模型。该数据库可通过 URL 访问:http://www.jenner.ac.uk/antijen。肽-MHC 复合物与 T 细胞受体结合、抗体与蛋白质抗原结合以及一般免疫学蛋白质-蛋白质相互作用。该数据库还包含来自 MHC 和其他免疫分子的位置特异性肽库和生物物理数据的定量特异性数据,以扩散系数和细胞表面拷贝数的形式。AntiJen 的用途包括疫苗和诊断学的设计,例如四聚体和其他实验室试剂,以及帮助参数化免疫系统的生物信息学或数学模拟模型。该数据库可通过 URL 访问:http://www.jenner.ac.uk/antijen。该数据库还包含来自 MHC 和其他免疫分子的位置特异性肽库和生物物理数据的定量特异性数据,以扩散系数和细胞表面拷贝数的形式。AntiJen 的用途包括疫苗和诊断学的设计,例如四聚体和其他实验室试剂,以及帮助参数化免疫系统的生物信息学或数学模拟模型。该数据库可通过 URL 访问:http://www.jenner.ac.uk/antijen。该数据库还包含来自 MHC 和其他免疫分子的位置特异性肽库和生物物理数据的定量特异性数据,以扩散系数和细胞表面拷贝数的形式。AntiJen 的用途包括疫苗和诊断的设计,例如四聚体和其他实验室试剂,以及帮助参数化免疫系统的生物信息学或数学模型。该数据库可通过 URL 访问:http://www.jenner.ac.uk/antijen。以及帮助参数化免疫系统的生物信息学或数学模拟模型。该数据库可通过 URL 访问:http://www.jenner.ac.uk/antijen。以及帮助参数化免疫系统的生物信息学或数学模拟模型。该数据库可通过 URL 访问:http://www.jenner.ac.uk/antijen。

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