蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

计算工具在 miRNA 及其目标 SNP 鉴定中的应用

乔治·普里亚·多斯。C、Dike IP 和 Rao Sethumadhavan

微小RNA(miRNA) 是一类小的非蛋白质编码 RNA，通过靶向裂解或翻译抑制发挥重要的调节作用，并参与多种生物学功能。大量生物学数据的积累表明miRNA可以作为抑癌基因和癌基因发挥作用。突变、错误表达和成熟 miRNA 加工的改变与癌发生和肿瘤进展有关。miRNA 中常见的单核苷酸多态性 (SNP) 可能通过改变 miRNA 表达和/或成熟来改变其特性，因此它们可能对数千个靶标 mRNA 产生影响，从而产生不同的功能后果。在这项工作中，我们使用计算工具来预测结肠癌基因中 miRNA 靶向的 mRNA 的功能作用。我们提出了一种允许使用 PupaSuite 的方法，