国际标准期刊号: 2161-0517
KVAshwathappa1*、V.Venkataravanappa1、M. Nandan2、Shridhar Hiremath2、HDVinaykumar2、KS Shankarappa3、M. Krishna Reddy1、CN Lakshminarayana Reddy2
蜀葵是一种重要的观赏植物,生长在世界各地的花园床上。它容易受到多种病原体引起的多种疾病的影响。这些病毒病原体正在对蜀葵造成巨大的损害。本研究的目的是鉴定与蜀葵黄脉花叶病 (YVM) 和卷叶病 (EnLC) 复合病相关的 Begomovirus 和 DNA 卫星。表现出典型 Begomovirus 样症状的蜀葵植物样本是从印度新德里的普萨校区采集的。为了了解与受感染的蜀葵样品相关的 begomovirus 的状态,使用病毒特异性引物对对分离的总基因组 DNA 进行 PCR 扩增。部分基因组(1. 2 kb)与 10 个蜀葵样本(YVM 和 EnLC 表型各 5 个)相关的 Begomovirus 的测序表明它们与 Begomovirus、棉卷叶木尔坦病毒 (CLCuMuV) 有更多的同源性。10 个蜀葵样品之间的核苷酸同一性超过 95%。因此,选择显示 YVM 的两个代表性样本(H1 和 H2)和显示 EnLC(H3)的一个样本,使用 RCA 方法对病毒进行全长基因组扩增。样品显示DNA-B特异性引物没有扩增,并且对β卫星和α卫星特异性引物进行扩增,表明与蜀葵相关的begomovirus是单部分begomovirus。使用序列分界工具 (SDT) 对三种 Begomovirus 的完整基因组进行两两比较,显示最高核苷酸 (nt) 同一性为 88.0 至 92。7% 的基因组包含 CLCuMuV,92.5-96% 的 β 卫星序列包含 Ludwigia Leaf Distortion Betasatellite (LuLDB),90.4-93.2% 的 α 卫星序列包含 Ageratum Enation α 卫星 (AEV)。进一步的重组分析表明,所研究的begomovirus和DNA卫星是源自先前报道的begomovirus和DNA卫星的重组体。