蛋白质组学与生物信息学杂志

蛋白质组学与生物信息学杂志
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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

使用功能蛋白序列对阿尔茨海默病进行生物信息分析

阿拉姆·阿帕·拉奥、基兰·库马尔·雷迪和哈努曼·托塔

阿尔茨海默病是一种进行性神经退行性疾病,其特征是由聚集的淀粉样β斑块组成的淀粉样斑块沉积,以及由过度磷酸化的tau蛋白组成的神经原纤维缠结,导致突触缺陷,导致神经炎性营养不良和神经元死亡。淀粉样前体蛋白 (APP)、PS-1(位于 14 号染色体上的早老素-1)、PS-2(位于 1 号染色体上的早老素-2)基因的错义突变会改变 APP 的蛋白水解并增加 Aâ42(淀粉样蛋白 â)的生成-42)。Aâ42 作为弥漫性斑块的积累会引发小胶质细胞激活和细胞因子释放形式的炎症反应。此外,激酶和磷酸酶之间平衡的扰动会导致 tau 蛋白过度磷酸化。

在本研究中,我们从在线提供的各种生物数据库中提取了大量数据。研究发现,有74个基因可能导致阿尔茨海默病。我们利用ClustalW工具进行多重序列比对,评估了74个可能与阿尔茨海默病有关的蛋白质的作用,并利用功能蛋白序列构建了系统发育树。摘自 NCBI。使用生物信息学方法中的邻接算法构建系统发育树。本研究结果表明PS-1、PS-2和APP在阿尔茨海默病的发病机制中起主导作用。本研究提出了一种可能性,即与环境、代谢和年龄相关因素相比,遗传因素在阿尔茨海默病中更为重要。

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