蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

BIOSPEAN:用于处理 MALDI 完整细胞/孢子质谱光谱的免费软件工具

马丁·劳斯和马雷克·塞贝拉

这里我们介绍BIOSPEAN软件,该软件适用于处理从MALDI完整细胞/孢子质谱获得的肽/蛋白质谱。它是使用通用技术开发为网络应用程序的。BIOSPEAN 自动查找质谱中的峰。峰值检测原理涉及对各个 m/z 位置周围的强度值进行局部扫描。为了应对噪声水平,调整阈值信噪比以过滤相关结果。基于检测到的峰模式,随后可以在定制光谱数据库中执行相似性搜索以进行样品识别。当通过与数据库条目进行比较来分析光谱时,百分比分值是根据找到的相同峰位置的数量(它们分配有可调整的质量容差)除以分析谱中所有检测到的峰的数量来计算的。还可以以相反的方式比较每两个光谱并对两个分数值进行平均。数据库搜索结果最终排序在表格中。

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